克制不同忍者的核心在于理解属性克制机制与技能特性。游戏内忍者属性分为水、火、风、雷、土五种，遵循水克火、火克风、风克雷、雷克土、土克水的循环关系。触发对应属性技能时，克制方会获得额外伤害加成，因此在阵容搭配上应优先选择能压制对手属性的忍者。部分忍者如波风水门（风属性）或宇智波鼬（火属性）的技能效果与属性绑定，需针对性调整站位与出手顺序。实战中可通过长按敌方忍者头像提前查看属性，避免己方被反向克制。
针对高机动型忍者如波风水门或泳装小南，需注重走位预判与技能反制。这类忍者通常依赖位移技能起手，可通过螺旋走位或反向跑位诱导其技能落空。例如面对水门的飞雷神时，可观察其苦无投掷轨迹提前规避，或在神速突进后利用抓取类技能反打。秘卷选择上推荐携带霸体、扦插之术等硬控类技能，限制对手的连续进攻节奏。通灵兽搭配蛤蟆仙人或蓝蛇可提供关键的控制或爆发伤害窗口。
对于霸体或特殊机制忍者如奇拉比或百豪纲手，需依赖抓取技能或高爆发组合破解。霸体状态下普通攻击无法造成僵直，但抓取类技能（如扦插之术、魔幻·树缚杀）可强行打断其状态。若敌方携带霸体秘卷，则需保留替身术或无敌帧技能应对反打。部分忍者如百豪纲手拥有持续回复能力，可通过高频伤害或点燃类效果压制其血量恢复，避免陷入消耗战。
远程消耗型忍者如蝎或迪达拉，需利用Y轴移动与障碍物遮挡减少其技能命中率。这类忍者的普攻与技能多为直线或范围覆盖，通过纵向走位可有效规避伤害。秘卷可选择风杀阵或雷电击等远程压制技能，逼迫对方交出替身。若己方为近战忍者，则需借助突进技能快速拉近距离，或利用通灵兽创造近身机会。需注意，部分远程忍者的技能具有持续判定（如蝎的铁砂结袭），需谨慎选择替身时机。
例如敌方若存在双火属性忍者，己方可优先上场水属性角色形成压制。合理分配奥义技能的使用时机，避免在敌方替身术未冷却时释放关键奥义。通过属性克制、技能反制与战术配合，即使面对高强度忍者也能掌握对战主动权。
