口袋妖怪火红386版本作为经典改版，允许玩家在不联机的情况下收集全部386只宝可梦，其中神兽的分布和捕捉方法是核心玩法之一。该版本的神兽包括关都地区三圣鸟（急冻鸟、闪电鸟、火焰鸟）、超梦、梦幻，以及丰缘三神柱（岩神柱、冰神柱、钢神柱）、海皇牙、古拉顿、裂空座等。这些神兽通常隐藏在地图特定区域，需满足条件或使用特殊道具才能触发遭遇。部分神兽如代欧奇希斯、基拉祈等需在二周目或特殊场景中捕捉，而三圣鸟和超梦的获取方式与原版火红基本一致。
急冻鸟位于双子岛最深处，需用推岩石的方式堵住瀑布才能进入其栖息地；闪电鸟在无人发电站内部，火焰鸟则需登顶灯火山。超梦需在华蓝洞窟最深处遭遇，等级为70级，建议提前准备催眠或麻痹类技能以提高捕获率。梦幻的获取较为特殊，需在红莲岛废弃研究所的特定楼层使用寻宝机器触发。三神柱的捕捉需要分别在1号岛草地、双子岛及无人发电站遭遇，而海皇牙和古拉顿需使用超级钓竿或在地面草丛中随机遇到。
二周目新增的神兽如裂空座、代欧奇希斯等通常出现在高难度区域。裂空座可在冠军之路出口或特定岛屿的空中遭遇，代欧奇希斯则隐藏在华兰洞复杂地形层。雪拉比、基拉祈等幻兽需在特定岛屿的森林或洞窟中探索，部分需完成支线任务才能解锁。需386版本的神兽并非全部固定出现，部分需依赖随机遭遇机制，因此建议携带拥有复眼特性的宝可梦提升稀有精灵出现概率。
大师球是首选，但数量有限，建议优先用于高难度目标如超梦或裂空座。对于其他神兽，可借助刀背打技能控制血量，配合催眠粉或电磁波提升捕获率。部分神兽如岩神柱拥有高防御属性，建议携带特殊攻击型宝可梦应对。存档功能在遭遇神兽前尤为重要，避免因失误导致目标逃跑或战斗失败。
火红386版本的神兽分布设计兼顾了原版情怀与改版创新，玩家需综合运用地图探索、道具收集和战斗策略才能完成全图鉴。尽管部分神兽的获取条件较为苛刻，但通过系统化的规划和耐心尝试，仍能高效完成收集目标。
